Сотрудничество и партнерство в области наук о Земле является одним из приоритетных направлений деятельности ФИЦ ЕГС РАН, которое обеспечивает полноту и объективность получаемых данных об опасных природных процессах (землетрясения, цунами, извержения вулканов и др.) на всей Земле. С целью повышения эффективности фундаментальных и прикладных исследований организация имеет соглашения о научно-техническом сотрудничестве и обмене информацией с научными и научно-производственными учреждениями РФ (АН Чеченской республики и КНИИ РАН, ГЕОХИ РАН, «ГИ УрО РАН», ГИН ДВО РАН, ГоИ ФИЦ КНЦ РАН, ГПКК «КНИИГИМС», ДВГИ ДВО РАН, ДВГТУ, ИВиС ДВО РАН, ИГ ФИЦ Коми НЦ УрО РАН, ИГиП ДВО РАН, ИГЭ РАН, ИДГ РАН, ИЗК СО РАН, ИЗМИРАН, ИМГиГ ДВО РАН, ИНГГ СО РАН, Институт сейсмологии и геодинамики ФГАОУ ВО КФУ им. Вернадского, ИрГУПС, ИРНИТУ, ИСЗФ СО РАН, ИТиГ ДВО РАН, ИФА РАН, ИФЗ РАН, КамГУ им. Витуса Беринга, КарНЦ РАН, НИИФ им. В.А. Фока СПбГУ, КРАУНЦ, ЛИН СО РАН, МГУ им М.В.Ломоносова, МИТП РАН, ММБИ КНЦ РАН, НП «ЭЦ РОПР», ПГИ, РГГМУ, РГУ им. И. Канта, СВКНИИ ДВО РАН, ТИфСВФУ, ТОИ ДВО РАН, ФГБОУ ВО «ВГУ»).

Также ФИЦ ЕГС РАН осуществляет информационное взаимодействие в области предупреждения и ликвидации ЧС с региональными подразделениями ГУ МЧС России (Амурская область, Архангельская область, Астраханская область, Волгоградская область, Воронежская область, Запорожская область, Ивановская область, Иркутская область, Калининградская область, Магаданская область, Мурманская область, Саратовская область, Свердловская область, Нижегородская область, Орловская область, Забайкальский край, Камчатский край, Краснодарский край, Пермский край, Ставропольский край, Республика Башкортостан, Республика Дагестан, Республика Ингушетия, Кабардино-Балкарская республика, Карачаево-Черкесская республика, Республика Крым, Республика Саха (Якутия), Республика Северная Осетия – Алания, Республика Татарстан, Республика Тыва, Чеченская Республика, Чувашская Республика – Чувашия, Ненецкий автономный округ, Ханты-Мансийский автономный округ, г.Санкт-Петербург), а также с Департаментом ГОиЧСПБ г.Москва, ФГБУ «СИЦ Минтранса России», ГКУ КК ТЦММП ЧС, СПб УГПС МЧС России.

В рамках международного сотрудничества ФИЦ ЕГС РАН ведет обмен информацией об опасных природных явлениях с мировыми и национальными сейсмологическими агентствами и организациями:

• Республиканский центр сейсмологической службы Национальной академии наук Азербайджана
• Институт Геофизики и инженерной сейсмологии им. А. Назарова Национальной академии наук Республики Армения
• Национальная служба сейсмической защиты Республики Армения
• Центр геофизического мониторинга Национальной академии наук Беларуси
• Институт геофизических исследований Национального ядерного центра Министерства Энергетики Республики Казахстан
• ТОО «Национальный научный центр сейсмологических наблюдений и исследований» Министерства по чрезвычайным ситуациям Республики Казахстан
• Институт сейсмологии Национальной академии наук Кыргызской республики
• Институт астрономии и геофизики Академии наук Монголии
• Комплексная экспедиция Института Сейсмологии Академии наук Республики Узбекистан
• Alaska Volcano Observatory (AVO) the Geophysical Institute of the University of Alaska Fairbanks
• Department of Earth and Environmental Sciences at Michigan State University (MSU)
• EARTHSCOPE CONSORTIUM, INC.
• European-Mediterranean Seismological Centre (EMSC)
• Institute of Informatics and Telecommunications of Harbin Engineering University
• International Seismological Centre (ISC)
• Korea Institute of Geoscience and Mineral Resources (KIGAM)
• Lamont-Doherty Earth Observatory of Columbia University in the City of New York
• National Research Institute for Earth Science and Disaster Resilience (NIED)
• NORSAR
• Support to Aviation Control System (SACS) of Royal Belgian Institute for Space Aeronomy
• Volcanic Ash Advisory Center (VAAC)
• Weathernews Inc.